Protein–RNA interactions for Protein: O14503

BHLHE40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE40O14503 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
BHLHE40O14503 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms