Protein–RNA interactions for Protein: J3QRK9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QRK9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
J3QRK9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3QRK9 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3QRK9 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3QRK9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3QRK9 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3QRK9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
J3QRK9 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QRK9 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QRK9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QRK9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QRK9 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QRK9 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QRK9 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QRK9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QRK9 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QRK9 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QRK9 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QRK9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QRK9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QRK9 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QRK9 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QRK9 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QRK9 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QRK9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QRK9 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QRK9 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QRK9 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QRK9 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QRK9 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QRK9 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QRK9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QRK9 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QRK9 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QRK9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QRK9 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QRK9 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QRK9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QRK9 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QRK9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QRK9 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QRK9 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QRK9 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
J3QRK9 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QRK9 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QRK9 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QRK9 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QRK9 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QRK9 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QRK9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QRK9 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QRK9 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QRK9 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QRK9 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QRK9 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QRK9 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QRK9 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QRK9 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QRK9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QRK9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QRK9 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QRK9 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QRK9 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QRK9 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QRK9 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QRK9 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QRK9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QRK9 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QRK9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QRK9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QRK9 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
J3QRK9 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms