Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ERVV-1B6SEH8 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms