Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
SMIM1B2RUZ4 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms