Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
HMGB1P1B2RPK0 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms