Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PTPDC1A2A3K4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PTPDC1A2A3K4 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms