Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
E2F8A0AVK6 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms