Protein–RNA interactions for Protein: V9GYS6

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V9GYS6 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V9GYS6 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V9GYS6 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
V9GYS6 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
V9GYS6 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V9GYS6 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V9GYS6 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
V9GYS6 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
V9GYS6 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V9GYS6 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V9GYS6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V9GYS6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V9GYS6 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V9GYS6 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
V9GYS6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V9GYS6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
V9GYS6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
V9GYS6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
V9GYS6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
V9GYS6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
V9GYS6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
V9GYS6 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
V9GYS6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V9GYS6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V9GYS6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V9GYS6 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V9GYS6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V9GYS6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V9GYS6 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V9GYS6 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
V9GYS6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
V9GYS6 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V9GYS6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V9GYS6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
V9GYS6 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
V9GYS6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
V9GYS6 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
V9GYS6 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
V9GYS6 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
V9GYS6 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
V9GYS6 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
V9GYS6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
V9GYS6 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
V9GYS6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
V9GYS6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
V9GYS6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
V9GYS6 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
V9GYS6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
V9GYS6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms