Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y625

GPC6, Glypican-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC6Q9Y625 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 AC079416.2-201ENST00000625035 1193 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GPC6Q9Y625 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms