Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SNX10Q9Y5X0 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX10Q9Y5X0 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX10Q9Y5X0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX10Q9Y5X0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX10Q9Y5X0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX10Q9Y5X0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX10Q9Y5X0 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX10Q9Y5X0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX10Q9Y5X0 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX10Q9Y5X0 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SNX10Q9Y5X0 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX10Q9Y5X0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX10Q9Y5X0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX10Q9Y5X0 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX10Q9Y5X0 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX10Q9Y5X0 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX10Q9Y5X0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX10Q9Y5X0 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX10Q9Y5X0 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX10Q9Y5X0 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX10Q9Y5X0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX10Q9Y5X0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX10Q9Y5X0 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX10Q9Y5X0 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX10Q9Y5X0 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX10Q9Y5X0 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX10Q9Y5X0 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX10Q9Y5X0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX10Q9Y5X0 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX10Q9Y5X0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX10Q9Y5X0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX10Q9Y5X0 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX10Q9Y5X0 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SNX10Q9Y5X0 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms