Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4B4

RAD54L2, Helicase ARIP4, humanhuman

Predictions only

Length 1,467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.32
RAD54L2Q9Y4B4 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC29.5■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC29.47■■■□□ 2.31
RAD54L2Q9Y4B4 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms