Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
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USP18Q9UMW8 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
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USP18Q9UMW8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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USP18Q9UMW8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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USP18Q9UMW8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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USP18Q9UMW8 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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USP18Q9UMW8 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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USP18Q9UMW8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
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USP18Q9UMW8 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
USP18Q9UMW8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
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