Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
RAB23Q9ULC3 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
RAB23Q9ULC3 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms