Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKX3

MYH13, Myosin-13, humanhuman

Predictions only

Length 1,938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYH13Q9UKX3 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
MYH13Q9UKX3 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MYH13Q9UKX3 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms