Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PACSIN3Q9UKS6 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms