Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK58

CCNL1, Cyclin-L1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL1Q9UK58 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNL1Q9UK58 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms