Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIK5

TMEFF2, Tomoregulin-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEFF2Q9UIK5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
TMEFF2Q9UIK5 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEFF2Q9UIK5 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEFF2Q9UIK5 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEFF2Q9UIK5 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
TMEFF2Q9UIK5 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms