Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHB9

SRP68, Signal recognition particle subunit SRP68, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP68Q9UHB9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRP68Q9UHB9 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP68Q9UHB9 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms