Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
KDM5BQ9UGL1 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
KDM5BQ9UGL1 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms