Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ABCF2Q9UG63 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ABCF2Q9UG63 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms