Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBQ0

VPS29, Vacuolar protein sorting-associated protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS29Q9UBQ0 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
VPS29Q9UBQ0 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VPS29Q9UBQ0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 565.7 ms