Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USP35Q9P2H5 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
USP35Q9P2H5 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
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