Protein–RNA interactions for Protein: Q9P270

SLAIN2, SLAIN motif-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAIN2Q9P270 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLAIN2Q9P270 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLAIN2Q9P270 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLAIN2Q9P270 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLAIN2Q9P270 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SLAIN2Q9P270 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLAIN2Q9P270 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLAIN2Q9P270 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLAIN2Q9P270 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SLAIN2Q9P270 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLAIN2Q9P270 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLAIN2Q9P270 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLAIN2Q9P270 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLAIN2Q9P270 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLAIN2Q9P270 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SLAIN2Q9P270 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SLAIN2Q9P270 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms