Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
ZDHHC3Q9NYG2 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC17.71■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
ZDHHC3Q9NYG2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms