Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY47

CACNA2D2, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D2Q9NY47 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CACNA2D2Q9NY47 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms