Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX77

ERVK13-1, Endogenous retrovirus group K member 13-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK13-1Q9NX77 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ERVK13-1Q9NX77 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ERVK13-1Q9NX77 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms