Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
TDP1Q9NUW8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
TDP1Q9NUW8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
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