Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SMC4Q9NTJ3 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SMC4Q9NTJ3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms