Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CENPMQ9NSP4 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms