Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RAB6BQ9NRW1 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.8 ms