Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF9

POLE3, DNA polymerase epsilon subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLE3Q9NRF9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
POLE3Q9NRF9 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms