Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD0

FBXO8, F-box only protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO8Q9NRD0 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FBXO8Q9NRD0 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms