Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR61

DLL4, Delta-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL4Q9NR61 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
DLL4Q9NR61 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
DLL4Q9NR61 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms