Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD15

SRA1, Steroid receptor RNA activator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRA1Q9HD15 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SRA1Q9HD15 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms