Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZM3

POLR2J2, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB11-b1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2J2Q9GZM3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
POLR2J2Q9GZM3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
POLR2J2Q9GZM3 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms