Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZM3

GSX2, GS homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSX2Q9BZM3 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
GSX2Q9BZM3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms