Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYX4

IFIH1, Interferon-induced helicase C domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,025 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIH1Q9BYX4 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFIH1Q9BYX4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFIH1Q9BYX4 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFIH1Q9BYX4 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFIH1Q9BYX4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFIH1Q9BYX4 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFIH1Q9BYX4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
IFIH1Q9BYX4 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
IFIH1Q9BYX4 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
IFIH1Q9BYX4 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
IFIH1Q9BYX4 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
IFIH1Q9BYX4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
IFIH1Q9BYX4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms