Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYW2

SETD2, Histone-lysine N-methyltransferase SETD2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SETD2Q9BYW2 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SETD2Q9BYW2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms