Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY43

CHMP4A, Charged multivesicular body protein 4a, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP4AQ9BY43 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CHMP4AQ9BY43 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CHMP4AQ9BY43 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms