Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RAB11FIP5Q9BXF6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 324.3 ms