Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BRIP1Q9BX63 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BRIP1Q9BX63 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms