Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
HIGD2AQ9BW72 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms