Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVW6

SMIM2, Small integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM2Q9BVW6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM2Q9BVW6 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM2Q9BVW6 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM2Q9BVW6 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM2Q9BVW6 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM2Q9BVW6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM2Q9BVW6 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM2Q9BVW6 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM2Q9BVW6 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM2Q9BVW6 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM2Q9BVW6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM2Q9BVW6 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM2Q9BVW6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM2Q9BVW6 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM2Q9BVW6 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM2Q9BVW6 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM2Q9BVW6 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM2Q9BVW6 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM2Q9BVW6 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM2Q9BVW6 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM2Q9BVW6 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM2Q9BVW6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM2Q9BVW6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM2Q9BVW6 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM2Q9BVW6 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM2Q9BVW6 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM2Q9BVW6 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM2Q9BVW6 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM2Q9BVW6 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM2Q9BVW6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM2Q9BVW6 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM2Q9BVW6 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM2Q9BVW6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
SMIM2Q9BVW6 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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SMIM2Q9BVW6 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
SMIM2Q9BVW6 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
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