Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERPUD2Q9BSE4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms