Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
LPIN3Q9BQK8 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LPIN3Q9BQK8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LPIN3Q9BQK8 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LPIN3Q9BQK8 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
LPIN3Q9BQK8 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LPIN3Q9BQK8 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
LPIN3Q9BQK8 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LPIN3Q9BQK8 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LPIN3Q9BQK8 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LPIN3Q9BQK8 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
LPIN3Q9BQK8 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
LPIN3Q9BQK8 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LPIN3Q9BQK8 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LPIN3Q9BQK8 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
LPIN3Q9BQK8 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms