Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ95

ECSIT, Evolutionarily conserved signaling intermediate in Toll pathway, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECSITQ9BQ95 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ECSITQ9BQ95 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms