Protein–RNA interactions for Protein: Q99684

GFI1, Zinc finger protein Gfi-1, humanhuman

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Length 422 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1Q99684 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFI1Q99684 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GFI1Q99684 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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GFI1Q99684 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GFI1Q99684 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GFI1Q99684 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GFI1Q99684 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GFI1Q99684 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
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GFI1Q99684 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1Q99684 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1Q99684 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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GFI1Q99684 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1Q99684 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1Q99684 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
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GFI1Q99684 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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GFI1Q99684 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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GFI1Q99684 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1Q99684 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1Q99684 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1Q99684 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1Q99684 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1Q99684 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFI1Q99684 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1Q99684 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1Q99684 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1Q99684 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1Q99684 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1Q99684 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1Q99684 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1Q99684 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1Q99684 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1Q99684 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1Q99684 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1Q99684 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1Q99684 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1Q99684 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1Q99684 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1Q99684 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1Q99684 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFI1Q99684 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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