Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC17■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
DCHS1Q96JQ0 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms