Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ5

MS4A3, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A3Q96HJ5 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AL121972.2-201ENST00000431108 556 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 LINC01075-201ENST00000455977 370 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 OR4A19P-201ENST00000533579 1103 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AC007570.1-201ENST00000539987 603 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 CASP5-205ENST00000444749 1237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 LYRM7-203ENST00000510516 604 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 PTS-204ENST00000525803 625 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AC091151.1-201ENST00000587369 726 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AC090373.1-201ENST00000623955 603 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 CFAP97-201ENST00000296775 903 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 LYG1-201ENST00000308528 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 PYM1-202ENST00000398213 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AP003400.5-201ENST00000624827 617 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
MS4A3Q96HJ5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms