Protein–RNA interactions for Protein: Q96G01

BICD1, Protein bicaudal D homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICD1Q96G01 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BICD1Q96G01 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BICD1Q96G01 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BICD1Q96G01 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
BICD1Q96G01 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms